以应对在研究中所产生的海量数据

2020-11-18 02:14

昆虫是所有生物中种类及数量最多的群体,据估计世界上昆虫种类大约有100多万种。昆虫种类的多样性、行为和生理的多样性以及遗传多样性在生物界中都是最高的,这正是昆虫类对环境的适应和亿万年长期进化的结果。但是,到目前为止,导致昆虫高度多样性的原因和内在的遗传机制并不完全清楚。在本研究中,科研人员希望通过对昆虫进行转录组学的研究,可以更好地了解昆虫的遗传进化机制,为生物多样性、农业和人类健康等研究奠定重要的科研基础。

中国经济网深圳2月7日讯 (记者杨阳腾 李小芳) 中国经济网记者今日从深圳华大基因研究院获悉,2月2日,来自深圳华大基因研究院、德国波恩动物学博物馆和美国罗格斯大学等近20家单位的科研人员共同宣布,该研究联盟将在未来两年内开展1000种昆虫的转录组研究,望能揭开昆虫进化之谜。

转录组学就是从rna水平研究基因表达的情况,同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。在本项目中,研究人员将通过1000种昆虫的转录组数据分析,构建一个强健的昆虫系统进化树。本项目的发起人之一、德国波恩动物学博物馆的bernhard misof教授表示:“该项目所产生的转录组学数据将为构建最好的昆虫系统进化树奠定重要的基础,对比较基因组学和进化研究也具有十分重要的意义。”

据悉,该项目被称为国际“千种昆虫转录组进化”(1k insect transcriptome evolution,1kite)研究项目,由来自澳大利亚、奥地利、中国、德国、日本、墨西哥、新西兰和美国的50多位不同领域的知名专家共同参与。在本项目中,华大基因将依托其先进的新一代测序平台和强大的生物信息分析能力,承担核心分析和该项目的整体组织协调工作。

昆虫作为物种多样性最丰富的动物类群,它们在除海洋外的几乎所有生态系统中都起到关键性的作用。很多昆虫都具有极大的经济和医学价值,包括农作物害虫、传媒昆虫、病原载体及关键物种等。该项目的发起人之一、华大基因国家基因库生物资源库负责人周欣博士指出:“昆虫是构成自然界生物多样性的一个重要组成部分,我们希望从基因组学角度揭示昆虫与生态系统之间的相互作用、昆虫高度多样性的成因及其适应复杂多样环境的遗传进化机制。”

据了解,在本项目中,研究人员还将致力于新的生物信息学分析方法的开发,以应对在研究中所产生的海量数据。德国海德堡理论研究所的alexandros stamatakis教授说:“如今生命科学技术迅速发展,由此产生的研究数据也呈指数增长,对这些海量而复杂的数据的存储和分析在不久的将来将会成为真正的挑战。”